保函业务审计的内容主要包括：
1、审查被审计单位经营的合规性及是否严格执行相关制度办法。
2、审查被审计单位内部控制的有效性。
3、审查被审计单位经营的风险性。
4、审查被审计单位是否存在违规担保的情况。
其中保函业务审计指审计机构对商业银行办理保函业务过程中程序的合法性和规范性，以及是否符合国际惯例和遵循国家的法律规章制度等情况所开展的审查监督活动。开展保函业务审计的目的在于确保被审计单位保函业务工作的专业性和规范性，从而提高市场金融活动的合法性及合理性。
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