主管药师考试科目有基础知识、相关专业知识、专业知识和专业实践能力四个，主管药师考试采用人机对话的考核方式，每个考试科目考试时长均为90分钟，科目与科目之间间隔为45分钟，考生在1天参加完这四个科目的考试。
主管药师考试题型具体为A1型题（单句型最佳选择题）、A2型题（病例摘要型最佳选择题）、A3型题（病例组型最佳选择题）、A4型题（病例串型最佳选择题）、B1型题（标准配伍题）五种，每科题量100问，每题1分，满分100分。
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