吉首大学医学系开设的专业有：临床医学、护理学、针灸推拿学、医学影像技术和医学检验技术等五个全日制本科专业。其中临床医学、护理学、针灸推拿学被评为省级一级本科专业。
从毕业生的就业情况来看，医学院校本科生的总体就业率为85.28%。由于医学专业的特殊性，仅凭学士学位是不容易找到工作的。吉首大学医学院毕业生就业率能达到85%以上，这是一个很好的成绩，这间接反映了吉首大学医学院的办学实力和社会认可度。
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