长治医学院设有教学院(系、部)20个:第一临床学院、第二临床学院、基础医学部、护理学系、人文艺术传媒学系、公共卫生与预防医学系、医学影像学系、生物医学工程学系、麻醉学系、医学检验系、药学系、口腔医学系、卫生信息与管理系、精神卫生系、思想政治理论课教学研究部、公共体育部、外语教学部、计算机教学部、继续教育学院、职业技术教育学院。
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