农产品是根据农产品的发票计算扣除的，如果不进行计算并认证，是不能进行扣除的，所以必须要计算一下。
《农产品增值税进项税额核定扣除试点实施办法》（财税〔2012〕38号 ）明确规定，农产品核定扣除办法规定的扣除率为销售货物的适用税率。如果纳税人生产的货物适用税率由16%调整为13%，则其扣除率也应由16%调整为13%；如果纳税人生产的货物适用税率由10%调整为9%，则其扣除率也应由10%调整为9%。
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