员工报销没有发票的处理如下：
1、由责任人提供发票来报销，如果提供不了发票，公司又对这个费用是认可的，可以对费用暂估入账，但要提供相应说明作为证据。暂估入账的费用在纳税申报时要做相应调整，不能在所得税前扣除。
2、如果无法证明费用真实发生了，其他应收款又确定收不回来，可以计提坏账准备。当然坏账准备同样不能在所得税前扣除。
补充：如何理解无发票还可以报销的理念？
没有发票能不能报销和费用能不能在所得税前扣除。这俩个概念是不一样的。费用发生了且能提供证明真实发生的，有没有发票没关系，会计都应将之作为费用正常报销处理。税务要求更严格，不仅要求费用必须真实发生，还需要提供发票做佐证。所以说，没有发票只要是支出的费用都是要做入会计账的，如果不符合税务的规定，可能所得税的汇算清缴时进行纳税调整就可以了。
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