、招聘方式不同
合同工是通过人事部门发布招聘信息，通过面试流程后，与其签订劳动合同，建立的是劳动关系；编制工则是通过公务员考试、事业单位考试等方式获得工作。
2、编制的不同
在事业单位上班的人员中，主要分两类：一类就是真的事业编制人员，另一类就是编外人员。编制内可以具体分为普通管理岗、专业技术岗、工勤人员等，这些也就是我们常说的“金饭碗”的人员。
编制外人员就是事业单位临时招聘过来协助事业单位编制人员干活的人，主要就是指合同工、劳务派遣的人员。他们工作没有保障，合同期一到，有随时被解聘的可能。
3、工资福利待遇不同
这个差别还是有点大的，有编制的人员一个月工资在6000左右，没有编制的人员就可能只有2500左右了。甚至编制内人员的公积金都比编制外人员的工资要高。此外，编制内人员还有养老保险、医疗保险、工伤保险等样样齐全。
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