一是研究方向不同。理学属于基础科学，注重理论研究，例如数学、天文学、光学、物理学、化学、地理学等，而工学更注重实际应用，研究的是技术，理论研究偏少。
二是学生结构不同。虽然说无论是理学还是工学，大部分都是以男生为主，但实际上，理学的女生要多一些，例如统计学、心理学大部分都是女生，因为很多理学专业高中文科生也能够报考。而工学大部分专业都是以男生为主，而且只有个别的三本院校的工科专业才允许高中文科生报考。
三是就业形式有差异。工学注重实际应用，因而就业上工学更具优势，例如计算机、软件工程、土木、建筑、电气等专业，毕业后非常吃香。而理学适合考研，从事科学研究。
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